《我在仙界搞科研》的剧情发生在一个融合了现代科技与古老仙术的奇幻世界中。主角，一位现代科研专家，因一次意外穿越到了仙界。在这个陌生的环境中，他发现自己所掌握的科技知识，在仙界有着无法想象的潜力和价值。

为了生存并回到自己的世界，主角开始利用现代科研技术，改良仙界的炼丹、炼器等方法，不仅大大提高了效率，还创造出了前所未有的神奇物品。他的成就引起了仙界各派的注意，有人想要拉拢他，也有人因嫉妒而暗中设下陷阱。

面对仙界的种种挑战，主角不仅展现了出色的科研能力，更以他的智慧和勇气，化解了一次次危机。在这个过程中，他也逐渐融入了仙界的生活，与仙界的朋友们共同面对未来的挑战。