《帝王计划：怪兽遗产》的剧情设定在哥斯拉与泰坦巨兽的激战之后，旧金山成为废墟，人类首次直面怪兽存在的现实。凯特，一位普通教师，在这场灾难中幸存，但她的生活却被一个惊人的秘密彻底打乱。这个秘密涉及她的家族与一个名为“帝王”的神秘组织。

为了揭开真相，凯特踏上了一段环球之旅。她不仅要面对隐藏在地球深处的各种怪兽，还要面对自己内心的恐惧和家族复杂的过去。在这个过程中，她逐渐了解到“帝王”组织的真正目的——探索和保护那些隐藏在地球深处的神秘生物，同时防止它们对人类造成威胁。

凯特的旅程充满了未知与危险，但她也在这个过程中找到了勇气与力量，最终揭示了家族与“帝王”组织之间错综复杂的联系，以及她自己在其中的位置。